C'est dans l'Ancienne Egypte, il y a de cela plus de 5000 ans déjà, que le jeu a été inventé. On dit même que ce n'était qu'un rituel magique du peuple égyptien pour élire son souverain. Ce rituel était plus connu sous le nom de "jeu des ténèbres"... Yûgi est un jeune garçon chétif qui se retrouve bien souvent seul. Pour passer le temps, il joue avec ses nombreux jeux et jouets, parmi lesquels se trouve un mystérieux puzzle millénaire qui, une fois reconstitué dit-on, exaucerait les voeux du détenteur. Miraculeusement, le garçon parvient un jour à le reconstituer et se "métamorphose" aussitôt en un deuxième Yûgi plus ténébreux et plus sûr de lui. Sous cette forme, il semble défendre la justice en donnant la "sanction de destin" à ceux qui osent se mettre sur son chemin. Il se nouera par la suite d'amitié avec Jôno-Uchi, un type qui jadis se moquait de lui. Il sera également confronté à des adversaires tout aussi redoutables que perfides dans divers catégories de jeux. Mais le plus coriace d'entre eux se nomme Kaiba, un expert dans "Magic & Wizards", un jeu de cartes qui fait fureur. Ceci nous menera bien plus tard au grand tournoi de ce jeu légendaire organisé par le créateur en personne, le redoutable mais néanmoins mystérieux Pegasus JR. Crawford...