Durant des guerres sans fin pour l'unification du Japon, un clan de guerriers invincibles nommé le Ninkû, parvient à mettre un terme à toute cette violence. Parmi eux, le grand maître de la première école, celle du rat, Fûsuke. Aujourd'hui, il part à la recherche de médicaments pour une vieille dame de son village qui est souffrante. Il fait en chemin la rencontre des autres grands maîtres et amis, Aichô le grand maître de l'école du coq, Tôji celui de l'école du serpent, Kisumi représentant cheval, Sekirai le dragon et bien d'autres. Mais tous ne sont pas aussi droits et justes, ainsi des ennemis tels les simples "maîtres Ninkû", profitent de l'après guerre pour exploiter les honnêtes gens grâce à leur force tirée de leur art martial de l'ombre. Fûsuke et les autres, ne pouvant permettre cela, vont tout faire pour restaurer l'ordre et la paix que mérite le pays. Cependant, une menace plus grande encore, va s'abattre sur eux, elle porte le nom de "la Compagnie du Loup", il s'agit d'un clan composé d'anciens disciples du Ninkû, qui possèdent des pouvoirs plus puissants encore que leurs maîtres !