Après quelques rapides années d'écoulées, le chemin se sépare pour les membres de la section primaire du lycée Saint François, qui était composée jusqu'alors de la présidente Natsuki Hayumi, des vice-présidents Misaki Miyamoto et Naozumi Yatsuka, d'Eri Kasugano, la responsable du comité disciplinaire, et enfin des deux secrétaires Eiji Horie et Seika Akishima. Natsuki part aux États-Unis pour entrer à l'université de Columbia, à des milliers de kilomètres de celle de Waseda, où Misaki, son bien-aimé, a adhéré. Durant la croisière scolaire de fin d'année, le paquebot essuie une terrible tempête, survenue sans crier gare. Plus tard, la jeune fille se réveille sur une plage à moitié endolorie. Elle découvre par la suite avec stupéfaction qu'elle a fait un bond dans le passé, se retrouvant ainsi au? XVIIe siècle !