Après sept années passées à l'école de magie, le petit Negi Springfield obtient finalement son précieux diplôme, qui marque avant toute chose le début de son stage pour devenir un grand magicien. Le garçon d'à peine 10 ans se voit attribuer le rôle de professeur d'anglais dans le collège Mahora, un établissement exclusivement réservé aux filles. Alors qu'il fait route pour sa première journée de cours, il rencontre sur son chemin Asuna Kagurazaka, une jeune fille agitée et d'un très fort tempérament. Ce qu'il ne sait pas tout de suite, c'est qu'elle fait partie de la classe dont il est le professeur principal, une situation qu'Asuna semble avoir bien du mal à supporter. Sa première journée de travail ne va visiblement pas être de tout repos, surtout lorsqu'il s'aperçoit qu'il n'arrive pas vraiment à se faire respecter du haut de son mètre quarante...