Shiki Tôno a été durant son enfance renversé par une voiture qui a provoqué une grave blessure à sa poitrine. Affublé d'une énorme cicatrice, il découvre sur son lit d'hôpital qu'il a hérité d'un pouvoir très singulier : il voit par défaut des espèces de lignes en chacun des objets et êtres vivants. En découpant ces lignes à l'aide d'un couteau, il est capable de détruire toute forme de vie. Quelques années plus tard, après avoir été élevé chez son oncle et sa tante, il rentre au manoir familial pour y retrouver sa petite s?ur, aujourd'hui à la tête de l'industrie Tôno. Le jour où il fait la rencontre dramatique d'Arcueid Brunestud, une mystérieuse jeune femme blonde, son quotidien va s'en retrouver bouleversé...