L'espace reste une grande énigme pour l'homme. Une fois que toutes les mers de la planète eurent disparu, une minorité d'individus décidèrent d'aller explorer l'infinie "mer noire". Et lorsqu'un jour, une étrange sphère de deux kilomètres de diamètre s'abattit sur la planète bleue, personne ne fit attention à elle, excepté le professeur Daiba qui tenta d'en savoir plus sur ce phénomène. Alors qu'il était en pleines recherches, il fut tué par une étrange femme. Cette dernière était sur le point d'en finir également avec son fils , le jeune Tadachi, lorsqu'intervint le capitaine Albator, le pirate de l'espace venu proposer au jeune homme de faire partie de son équipage afin de sauver la Terre de l'invasion extra-terrestre des Sylvidres dont faisait partie son agresseur. Nous sommes en l'an 2977 et l'aventure commence à bord de l'Arcadia, le grand vaisseau arborant le pavillon noir du capitaine Albator !